Acción como descomponedores de la materia orgánica.
Ciclo del Nitrógeno: conjunto cerrado de procesos biológicos y abióticos en que se basa el suministro de este elemento a los seres vivos. Es uno de los importantes ciclos biogeoquímico de que depende el equilibrio dinámico de composición de la biosfera.
Su reserva fundamental es la atmósfera, donde se encuentra en forma de N2. Existen bacterias y algas cianofíceas que pueden usar el N2 del aire y realizan la fijación del nitrógeno. De esta forma convierten el N2 en otras formas químicas (nitratos y amonio) asimilables por las plantas.
El amonio (NH4+) y el nitrato (NO3-) son absorbidos por las raíces de las plantas, y utilizan los átomos de N para la síntesis de las proteínas y ácidos nucleicos. Los animales obtienen su nitrógeno al comer a las plantas o a otros animales.
En el metabolismo de los compuestos nitrogenados en los animales acaba formándose ión amonio que es tóxico y debe ser eliminado. Esta eliminación se hace en forma de amoniaco (algunos peces y organismos acuáticos), o en forma de urea (el hombre y otros mamíferos) o en forma de ácido úrico (aves y otros animales de zonas secas). Estos compuestos van a la tierra o al agua de donde pueden tomarlos de nuevo las plantas o ser usados por algunas bacterias.
Algunas bacterias como (Rhizobium) convierten amoniaco en nitrito y otras transforman este en nitrato. Rhizobiumse aloja en nódulos de las raíces de las leguminosas (alfalfa, alubia, etc.) y por eso estas plantas constituyen un abonado natural de los suelos.
En lugares donde hay un exceso de materia orgánica en el mantillo, en condiciones anaerobias, hay otras bacterias que producen desnitrificación, convirtiendo los compuestos de N en N2, lo que hace que se pierda de nuevo nitrógeno del ecosistema a la atmósfera.
Es de destacar que el N suele ser uno de los elementos que escasean y que es factor limitante de la productividad de muchos ecosistemas.